نام و نام خانوادگی: روح اله عبدالوهاب
مرتبه علمی: استادیار
سمت: معاون آموزشی و مدیر تحصیلات تکمیلی، مدیرگروه فرهنگی
تلفن: ۹۸۲۱۷۳۲۲۵۸۸۷
داخلی: ۵۸۸۷
فاکس: ۷۷۲۴۰۴۹۷
آدرس پست الکترونیکی: rabdolvahab AT iust.ac.ir
آدرس: دانشکده فیزیک، دانشگاه علم و صنعت ایران، تهران،ایران
دانشگاههای محل تحصیل:
- دکتری، دانشگاه صنعتی شریف، تهران، ایران
- کارشناسی ارشد، دانشگاه صنعتی شریف، تهران، ایران
- کارشناسی، دانشگاه صنعتی شریف، تهران، ایران
زمینههای تحقیقاتی:
- ماده چگال نرم
- بیوفیزیک
- تحلیل دادههای کاتورهای
- سیستمهای پیجیده
- عبور پلیمر از حفره
شرح زمینههای تحقیقاتی
شبیه سازی های تمام اتمی
NAMD یکی از پکیجهای مشهور در زمینه شبیه سازی دینامیک مولکولی تمام اتمی مولکولهای زیستی است. با کمک این پکیج شبیه سازیهای متعددی در گروه بنده انجام می شود. از جمله:
- عبور DNA از درون نانوحفره
- برهم کنش نانوذرات با غشای سلولی
- عبور آب از نانولوله های کربنی
- پایداری غشای سلولی در شرایط دمایی و غلطت نمکهای متفاوت
- برهم کنش پروتئین اسپایک ویروس کرونا با سلول انسانی
شبیه سازیهای درشت دانه
علاوه بر شبیه سازیهای تمام اتمی، شبیه سازیهای مختلفی با تعریف پتانسیل مورد نظر برا ذرات درشت دانه با کمک پکیج اسپرسو ام دی انجام میشود، از جمله:
- بررسی عبور پلیمر از کانال در حضور نیرو های متفاوت
- بررسی عبور پلیمر از کانال در حضور نانوذرات
- بررسی پدیده عبور پلیمرها از کانالهای زیستی در درون سلول
برخی کارهای نظری
همچنین در زمینه فیزیک پلیمرها، خمش پروتئین، شبکههای عصبی و ماشین لرنینگ و همچنین تحلیل دادههای کاتورهای، برخی کارها از جمله موارد زیر دنبال میشود:
- تاثیر شلوغی بر پایداری و عبور پلیمر از نانوحفره
- مدلهای شبه آیزینگ برای بررسی خمش پروتئین
- بررسی بازسازی هوشمند شبکههای عصبی
- بررسی زبری سطوح لایههای نازک
دروس ارائه شده:
کارشناسی ارشد:
کارشناسی
- فیزیک پایه ۲
- ترمودینامیک
- بیوفیزیک
مقالات منتشر شده در مجلات و کنفرانس های ملی و بین المللی در ۵ سال اخیر
(مجلات)
Publications (Journals)
- Pore shapes effects on polymer translocation. RH Abdolvahab, MN Hamidabad. The European Physical Journal E ۴۳ (۱۲), ۱-۷(۲۰۲۰)
- Nanoparticle-assisted polymer translocation through a nanopore. MN Hamidabad, S Asgari, RH Abdolvahab. Polymer ۲۰۴, ۱۲۲۸۴۷(۲۰۲۰)
- Simulating the effect of adding BSF layers on Cu۲BaSnSSe۳ thin film solar cells. A Ghobadi, M Yousefi, M Minbashi, AHA Kordbacheh, ARH Abdolvahab, ... . Optical Materials ۱۰۷, ۱۰۹۹۲۷(۲۰۲۰)
- Effects of interaction between nanopore and polymer on translocation time. محمد رضا نیکنام حمید آباد, روح الله عبدالوهاب. پژوهش سیستم های بس ذره ای(۲۰۲۰)
- Characterization of ZnO, Cu and Mo Composite Thin Films in Different Annealing Temperatures. R Haji Abdolvahab, MR Zamani Meymian, N Soudmand. Chemical Methodologies ۴ (۳), ۲۷۶-۲۸۴(۲۰۲۰)
- Permutation Entropy as a Parameter of Characterizing the Surface of a Thin Film. MR Zamani Meymian, R Haji Abdolvahab. Chemical Methodologies ۴ (۲. pp. ۱۱۵-۲۱۹), ۱۵۲-۱۶۰(۲۰۲۰)
- Fractality and roughness of the ZnO: Cu composite thin films annealed in different temperatures. R Haji Abdolvahab, MR Zamani Meymian, N Soudmand Saravi, ... . Surface Engineering ۳۶ (۱), ۶۳-۶۸(۲۰۲۰)
- Translocation through a narrow pore under a pulling force. MN Hamidabad, RH Abdolvahab. Scientific reports ۹ (۱), ۱-۱۲(۲۰۱۹)
- Fractal characteristics of TiO۲-Ag nanocomposite films deposited by a grid-assisted co-sputtering method. MRZ Meymian, RH Abdolvahab, AK Mehr. Applied Surface Science ۴۸۰, ۵۹۳-۶۰۰(۲۰۱۹)
- Theoretical and experimental analyses of the deposited silver thin films. R Haji Abdolvahab, MR Zamani Meymian. Surface and Interface Analysis(۲۰۱۸)
- Non-equilibrium effects in chaperone-assisted translocation of a stiff polymer. RH Abdolvahab. Physics Letters A ۳۸۲ (۴), ۱۶۲-۱۶۷(۲۰۱۸)
- Effects of interaction between nanopore and polymer on translocation time. MN Hamidabad, RH Abdolvahab. arXiv preprint arXiv:۱۷۰۶.۰۵۸۱۰(۲۰۱۸)
- Chaperone driven polymer translocation through Nanopore: spatial distribution and binding energy. RH Abdolvahab. The European Physical Journal E ۴۰, ۴۱(۲۰۱۸)
- Non-equilibrium effects in chaperone-assisted translocation of a stiff polymer. RH Abdolvahab. Physics Letters A, online (۲۰۱۷)
- Chaperone driven polymer translocation through Nanopore: spatial distribution and binding energy. RH Abdolvahab. The European Physical Journal E, ۴۰, ۴۱ (۲۰۱۷)
- OmpF, a nucleotide-sensing nanoprobe, computational evaluation of single channel activities. RH Abdolvahab, H Mobasheri, A Nikouee, MR Ejtehadi. Physica A: Statistical Mechanics and its Applications, ۴۵۷, ۲۱۵ (۲۰۱۶)
- Investigating binding particles distribution effects on polymer translocation through nanopore. RH Abdolvahab. Physics Letters A, ۳۸۰, ۱۰۲۳ (۲۰۱۶)
- First passage time distribution of chaperone driven polymer translocation through a nanopore: Homopolymer and heteropolymer cases. RH Abdolvahab, R Metzler, MR Ejtehadi. Journal of Chemical Physics ۱۳۵, ۲۴۵۱۰۲ (۲۰۱۶)
|
مقالات مجلات:
- Non-equilibrium effects in chaperone-assisted translocation of a stiff polymer. RH Abdolvahab. Physics Letters A, online (۲۰۱۷) Q۲
- Chaperone driven polymer translocation through Nanopore: spatial distribution and binding energy. RH Abdolvahab. The European Physical Journal E, ۴۰, ۴۱ (۲۰۱۷) Q۲
- OmpF, a nucleotide-sensing nanoprobe, computational evaluation of single channel activities. RH Abdolvahab, H Mobasheri, A Nikouee, MR Ejtehadi. Physica A:. Statistical Mechanics and its Applications, ۴۵۷, ۲۱۵ (۲۰۱۶) Q۱
- Investigating binding particles distribution effects on polymer translocation through nanopore. RH Abdolvahab. Physics Letters A, ۳۸۰, ۱۰۲۳ (۲۰۱۶) Q۲
- First passage time distribution of chaperone driven polymer translocation through a nanopore: Homopolymer and heteropolymer cases. RH Abdolvahab, R Metzler, MR Ejtehadi. Journal of Chemical Physics ۱۳۵, ۲۴۵۱۰۲ (۲۰۱۶) Q۱
- Sequence dependence of the binding energy in chaperone-driven polymer translocation through a nanopore. RH Abdolvahab, MR Ejtehadi, R Metzler. Phys. Rev. E, ۸۳,۰۱۱۹۰۲ (۲۰۱۱) Q۱
- Analytical and numerical studies of sequence dependence of passage times for translocation of heterobiopolymers through nanopores. RH Abdolvahab, F Roshani, A Nourmohammad, M Sahimi, MRR Tabar. Journal of Chemical Physics, ۱۲۹, ۲۳۵۱۰۲ (۲۰۰۸) Q۱
|
مقالات کنفرانس:
- " رژیم حرکتی پلیمرهای عبوری از نانوحفره با استفاده از ذرات چسبنده "، یازدهمین کنفرانس ماده چگال انجمن فیزیک ایران، بهمن ۱۳۹۱ شاهرود
|