ارائه دهنده:
زینب نویدی قاضیانی
استاد راهنما:
آقایان دکتر بهروز مینایی، دکتر ناصر مزینی
استاد مشاور: دکتر علی شریفی زارچی
استاد ممتحن خارجی : دکتر مهدیه سلیمانی باغشاه
استاد ممتحن داخلی: دکتر محمد طاهر پیله ور
زمان : یکشنبه 10 دی ماه
مکان: دانشکده مهندسی کامپیوتر- طبقه سوم- اتاق 304
زینب نویدی قاضیانی دانشجوی کارشناسی ارشد آقایان دکتر بهروز مینایی، دکتر ناصر مزینی روز دوشنبه 1397/10/10 ساعت 10:30 در اتاق 304 واقع در طبقه سوم دانشکده کامپیوتر از پروژه کارشناسی ارشد خود تحت عنوان طراحی الگوریتم الگوکاوی ژنوم در دادههای زیستفناوری دفاع خواهند نمود.
چکیده پایان نامه:
بیماری سرطان به بیماریهایی اطلاق میشود که گروهی از سلولهای غیرطبیعی در بدن فرد ایجاد شده و در اثر تقسیم بی رویه میتوانند به سایر نقاط بدن انتشار پیدا کنند. این بیماری تاکنون جان میلیونها انسان را گرفته است و هماکنون یکی از مهمترین دغدغههای جامعهی علمی محسوب میشود. عدم شناخت دقیق مکانیزم این بیماری به دلیل پیچیدگی زیاد سیستم ایجاد و انتشار سلولهای سرطانی ،عامل اصلی عدم وجود درمان قطعی برای آن است. با پیشرفت تکنولوژیهای تولید دانش، روزبهروز دانش بشر در این زمینه افزایش مییابد و تحقیقات در این حوزه سعی دارند با ادغام دادههای متفاوت یک فرد، مانند دادههای بهدست آمده از ژنوم و ترانسکریپتوم، اطلاعات بیشتری در راستای تشخیص عملکرد بیماری و درمان موثرتر بیماران بهدست آورند. یکی از راهکارهای شناخت و درمان بیماریها، تشخیص جهشهای پیکری موجود در توالی ژنوم یک فرد است که بر اثر عوامل زیستی و محیطی ممکن است ایجاد شود. برخی از جهشها چنانچه در نواحی مهمی از ژنوم رخ دهند میتوانند عامل اختلال در عملکرد طبیعی سلول و ایجاد بیماری گردند و از این جهت تشخیص مکان دقیق آنها حائز اهمیت است. روشهای آماری و کامپیوتری بسیاری برای این مهم ارائه شده و در حال حاضر در حال بهرهبرداری هستند.
در سالهای اخیر نوعی دادهی زیستی به نام دنای بدون سلول توجه پژوهشگران را در حوزهی زیستشناسی و بیوانفورماتیک به خود جلب کرده است. تحقیقات انجام شده روی دنای بدون سلول بیماران اطلاعات بسیار مفیدی در اختیار دانشمندان قرار داده است. از آنجایی که این داده از روش غیرتهاجمی و با هزینهی نسبتا کم بهدست میآید، ارائهی ابزارهای کامپیوتری برای استخراج هوشمندانهی اطلاعات از این نوع داده میتواند گام بزرگی در راستای پیشگیری و درمان سرطان باشد. در این پژوهش با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک، نوار تولیدی به منظور تحلیل دادهی دنای بدون سلول و به طور دقیقتر استخراج جهشهای موجود در ژنوم تولید کردهایم. به دلیل اینکه ماهیت این داده با توالی بهدست آمده از ژنوم سلولهای بافت در بدن متفاوت است، ابزارهای موجود روی این داده عملکرد خوبی از خود نشان نمیدهند. همچنین با بکارگیری روشهای شبکهی عصبی عمیق پیچشی مدلی برای تشخیص جهش از دنای بدون سلول ارائه کردهایم. مدل پیشنهادی این پروژه نسبت به سایر ابزارهای مورد استفادهی تشخیص جهش در ژنوم به طرز معناداری عملکرد بهتری نشان داده است.
واژههای کلیدی: بیوانفورماتیک، دنای بدون سلول، تشخیص جهش، یادگیری ژرف، شبکهی عصبی پیچشی
از اساتید بزرگوار، دانشجویان گرامی و دیگر متخصصان و علاقه مندان به موضوع دفاعیه دعوت
می شود با حضور خود موجبات غنای علمی و ارتقای کیفی را فراهم سازند.
دانشکده مهندسی کامپیوتر مدیریت تحصیلات تکمیلی
|