دانشگاه علم و صنعت ايران در سال 1386 با همت معاونت علمی و فناوری رياست جمهوری و با توجه به  مأموريت‌های ايجاد هماهنگی و تقويت نظام علم، فناوری و نوآوری کشور و تکميل و تکامل چرخه نوآوری ملی در قالب برنامه‌های متعدد در سه حوزه علم، فناوری و نوآوری موفق به ايجاد و راه اندازي 4 ستاد از زير مجموعه معاونت علمی و فناوری رياست جمهوری گرديد.

معاونت علمی و فناوری رياست جمهوري در انجام مأموريت‌های خود به عنوان يک مرجع فوق ستادی عمل کرده و به هماهنگی، هم‌افزايی و تقويت ساختارها، برنامه‌ها، فعاليت‌ها و منابع وسيع کشور در حوزه علم، فناوری و نوآوری که در سطح وزارتخانه‌ها و دستگاه‌های اجرايی پراکنده است پرداخته و به طور کلی از ورود به سطوح ديگر عملياتی پرهيز کرده است.

معاونت علمی از ايجاد نهادها و مؤسسات وابسته خودداری کرده و اجرای هيچ طرح پژوهشی و فناوری را رأسا تقبل نکرده است. بودجه‌ای که مستقيماً در اختيار معاونت است. کمتر از 5 درصد بودجه پژوهش و فناوری کشور است که در قالب برنامه‌های مصوب دولت و مجلس در اختيار دستگاه‌های ذيربط قرار می‌گيرد و از طريق آن سعی می‌شود که بخش هر چه بيشتری از کل بودجه پژوهش و فناوری کشور هدفمند هم افزا و اثربخش شود و به صورت برنامه‌ای هزينه شود.

4 ستاد ايجاد شده در دانشگاه علم و صنعت ايران بدين شرح بوده و متشکل از افراد زير می باشند.

∅ ستاد هوافضا
- مدير همکاری های علمی، صنعتی و فناوری(دکتر سيدحسين سيدين)

- مدير امور پژوهش (دکتر ميرمحمدصادقی)

- دکتر اميرحسين دوائی مرکزی(عضو هيات علمی دانشکده مهندسی مکانيک)

- دکتر مرتضی منتظری (عضو هيآت علمی دانشکده مهندسی مکانيک)

∅ ستاد ميکروالکترونيک

- مدير همکاری های علمی، صنعتی و فناوری(دکتر سيدحسين سيدين)

- مدير امور پژوهش (دکتر ميرمحمدصادقی)

- دکتر ستار ميرزاکوچکی(رئيس پژوهشکده الکترونيک)

- دکتر سيد احمد محدث کسايی (عضو هيات علمی دانشکده مهندسی برق)

- دکتر شهرام محمدنژاد (عضو هيات علمی دانشکده مهندسی برق)

∅ ستاد انرژی های نو

- مدير همکاری های علمی، صنعتی و فناوری(دکتر سيدحسين سيدين)

- مدير امور پژوهش (دکتر ميرمحمدصادقی)

- دکتر شهرام جديد (رئيس پژوهشکده سبز)

- دکتر سوسن روشن ضمير(عضو هيات علمی دانشکده مهندسی شيمی)

∅ ستاد نانو

- مدير همکاری های علمی، صنعتی و فناوری(دکتر سيدحسين سيدين)

- مدير امور پژوهش (دکتر ميرمحمدصادقی)

- دکتر علی بيت اللهی ( عضو هيات علمی دانشکده مهندسی مواد و متالورژی)

- دکتر افشين نميرانيان (عضو هيات علمی دانشکده فيزيک)